祁连山脉是我国地形的一二级阶梯分界线，联系了柴达木盆地和内蒙古高原。祁连山的额高大山脉阻隔了来自太平洋湿润水汽，使之遇冷凝结成降水，滋养了河西走廊。为内陆和边疆的联系作出了突出的贡献。

　　祁连山是中国西部重要生态安全屏障，是黄河流域重要水源产流地，是中国生物多样性保护优先区域，国家早在1988年就批准设立了甘肃祁连山国家级自然保护区。

　　祁连山曾一度受到巨大的破坏。由于全球温度上升，祁连山的积雪大量融化，使得山脉的两端的泛滥期和枯水期都有所延长。雪线上升导致的后果使得生态系统变得脆弱。但更为重要的原因是由于人口的增长加大了环境的压力，而供需矛盾的激化使得放牧量显著增加，进而导致了植被退化和水土流失。除了过度放牧，由于祁连山地区的矿藏资源丰富，违法开采矿产资源也造成了水土流失和地表塌陷。还有就是水电设施的违法建设和运行导致了水系生态系统的破坏，下游的缺水断流现象愈加严重。而大量企业在进驻之后并没有严格按照相关标准的要求，废弃污染物的偷偷排放给大气、水和土壤都造成了极大的污染。以上中国种种都对祁连山本身脆弱的生态系统造成了极大的破坏，而整改不力则成了压死骆驼的最后一根稻草。至此，祁连山的生态环境可谓是雪上加霜。为此，政府相关部门大力进行补救和恢复，调整并优化产业结构，进行科研创新并建立统一的、协调的生态补偿机制。最近几年，祁连山的生态环境处于缓慢的恢复和发展之中。

　　今天，多年来的措施终于取得了成效，在近期，在祁连山北麓的甘肃省张掖市肃南裕固族自治县，出现了成群的国家一级保护动物藏野驴等觅食、追逐活动的景象。祁连山区野生动物资源得到有效保护，藏野驴、藏原羚、金雕等珍稀野生动物种群数量不断增加。动物愿意回来了，说明我们的治理恢复工作取得了成效。也希望能够看到越来越多的野生动物的回归。